Damanhur è il più grande ecovillaggio italiano e una comunità di ricercatori spirituali, che ha costruito un tempio sotterraneo nel Nord Italia. Gli abitanti di Damanhur si considerano una nazione indipendente, a parte l'Italia, anche se non sono riconosciuti come tali. Attraverso gli occhi di una giovane ragazza svedese arrivata lì per girare un documentario e poi decisa a restarci, "La scelta di restare" racconta luci e ombre all'interno della comunità spirituale, tra l'accusa di essere una setta e la creazione di una società alternativa possibile.